La table misAct rassemble des charactéristiques calculées sur chacun des graphes générées.
| nH | mean.cpH | mean.vv | max.maxDeg | mean.maxDeg | mean.btw | btwH |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 7 | -0.3463350 | 1.285714 | 4 | 2.500000 | 30.50000 | 69 |
| 4 | -0.3642767 | 2.250000 | 3 | 2.333333 | 35.00000 | 65 |
| 11 | -0.2899265 | 1.181818 | 2 | 2.000000 | 35.00000 | 85 |
| 7 | -0.3095017 | 1.857143 | 2 | 1.333333 | 28.33333 | 79 |
| 5 | -0.3500979 | 2.000000 | 4 | 2.333333 | 31.33333 | 66 |
| 4 | -0.4105571 | 1.750000 | 3 | 2.000000 | 36.50000 | 52 |
Les résultats sont résumés en regroupant les graphes par l’influence de leur acteur manquant :
| influence | count |
|---|---|
| major | 211 |
| medium | 153 |
| minor | 23 |
Tous les VEMtree ont convergé, mais pas de la même manière. L’algo VEMtree a trois critères d’arrêt :
Donc VEMtree peut s’être arrêté du fait de la borne inf indépendemment de la convergence sur les paramètres W et Omega. Dans ce qui suit, on voit que maxIter (qui vaut 200) n’a jamais été atteint, et que lorsque c’est la convergence de J qui permet l’arrêt de l’algorithme, Omega a convergé mais pas W.
## V1
## Min. : 5.00
## 1st Qu.: 11.00
## Median : 14.00
## Mean : 17.52
## 3rd Qu.: 20.00
## Max. :100.00
La qualité d’inférence est évaluée avec l’AUC, la PPV (TP/(TP+FP)) et le TPR (TP/(TP+FN)) des arêtes incluant l’acteur manquant, notés PPVH et TPRH. Ces valeurs sont calculées pour chaque graphes, et les proportion de valeurs supérieures à 0.8 sont mises en liens avec le nombre de voisins nH de l’acteur manquant.
| influence | count | med.auc | auc.prop50 |
|---|---|---|---|
| major | 211 | 1.00 | 100 |
| medium | 153 | 0.86 | 100 |
| minor | 23 | 0.84 | 100 |
| influence | count | med.ppvh | med.tprh | ppvh.prop50 | tprh.prop50 |
|---|---|---|---|---|---|
| major | 211 | 1.00 | 1.0 | 90.5 | 85.3 |
| medium | 153 | 0.67 | 0.6 | 54.9 | 54.2 |
| minor | 23 | 0.40 | 0.5 | 21.7 | 21.7 |
VEMtree was unable to infer the missing actor in some case of major influence:
## $seed
## [1] 10 24 43 65 80 81 120 128 135 158 238 269 304 305 318 338 367
La reconstruction de l’acteur manquant est évaluée par la corrélation entre le vecteur latent gaussien d’origine \(Z_H\), et le vecteur des moyennes inférées \(M_H\).
| influence | med.cor | prop50 |
|---|---|---|
| major | 0.84 | 88.6 |
| medium | 0.58 | 60.8 |
| minor | 0.46 | 43.5 |
VEMtree was unable to reconstruct missing actor in some major influence cases :
## [1] 10 24 43 48 65 80 81 98 120 128 135 155 158 171 181 238 269
## [18] 285 304 305 318 338 367 380
Etude de J, Jcor, Icl et diffJPLN en fonction de AUC, PPVH et corZM